События исторического сериала «Операция «Неман»» разворачиваются в самый разгар Великой отечественной войны, когда оперативно-розыскная группа контрразведки под руководством капитана Алехина разыскивает диверсионную группу. Диверсанты, которые называют себя группой «Неман», работают под руководством предателя Мищенко, а занимаются они тем, что собирают разведданные, которые так нужны командованию Вермахта для определения направления основного наступления Красной армии. Алехин вместе со своим отрядом в ходе поиска предателей отрабатывает одну версию за другой, но Мищенко постоянно удается скрыться.