События сериала «13 клиническая. Начало» разворачиваются в брежневские времена. Знаменитой 13-й клинической больницы еще нет даже на бумагах, а люди только начинают изучать необъяснимые явления. Советский Союз ищет лучших врачей, чтобы выйти за рамки традиционной медицины. Одним из медиков становится психоневролог Яна, которая сейчас переживает семейную драму. Яна спасает важного пациента – самого Леонида Ильича, но после этого исчезает ее сын. Чтобы спасти сына, женщина-врач должна стать вместилищем для сильного демона, параллельно с этим ей доверяют руководство первого в мире мистического госпиталя, который и станет через несколько лет той самой 13-й клинической. Яна с коллегами берется за изучение сущностей из других миров. А в это время в Кремле пытаются понять, как эти явления можно использовать в целях обороны.