Главный герой мультсериала «Фармацевт из параллельного мира» – аптекарь из Токио Кандзи Якутани, который после смерти любимой сестры от неизлечимой болезни решает посвятить свою жизнь изобретению лекарств. В тридцать лет Кандзи умирает, вероятно, от трудоголизма, но вдруг реинкарнируется и оказывается в теле тринадцатилетнего мальчишки Фальма де Медисис где-то в средневековой Европе. Это не самый простой мальчик, а сын потомственного аристократа и известного целителя, который лучше всех разбирается в магии. Отец учит Фальма готовить волшебные зелья, диагностировать разные болезни с помощью волшебства и изгонять злых духов, которые делают людей больными. Вот только мальчик считает, что все это неправильно. Через несколько лет главный герой станет взрослым и попытается реформировать этот жуткий средневековый мир с суевериями, астрологией и колдовством…