События мультфильма «Босоногий Гэн» разворачиваются в последние дни Второй Мировой Войны, но Япония все еще пытается продолжать воевать. Японцы смирились, многие понимают безуспешность этих попыток, но как-то пытаются убедить себя в лучшем. На фоне безумного кровопролития и хаоса, голода и нищеты, осталась одна семья, которая не забывает о человеческих ценностях. Глава семейства осуждает войну и с нетерпеньем ждет, когда жена родит ему четвертого ребенка. Последняя надежда рушится в один день. На город падает атомная бомба. Выжить удается только матери и старшему мальчику Гэну. С этого дня вся ответственность за мать и не родившуюся малышку ложится на плечи подростка.