Мультсериал «Добро пожаловать в класс превосходства» расскажет историю престижного учебного заведения Кодо Икусэи. Почти все выпускники этой школы впоследствии поступают в университеты, а потом получают хорошие должности. Удивительно то, что в Кодо Икусэи полная свобода: ученики школы не ограничены в выборе стилей причесок или аксессуаров, могут носить любую одежду и даже пропускать занятия. Эта школа кажется райским местом. Киетака Аянокодзи во время экзаменов допустил грубую ошибку, и его отправили в класс D. Над учениками того класса издеваются все школьники и учителя. Там парень заводит дружбу с Судзумэ Хорикитой и Кике Кусидой, и после этого его жизнь начинает круто меняться.