Главный герой мультфильма «Вселенная хакинга» - юный хакер Федор, который воспитывался в детском доме. Всю жизнь парень пытается найти родителей, которые оставили его в детстве, чтобы спросить у них, почему они так с ним поступили. Есть у Федора верные друзья, которые помогают ему во всех делах, в том числе в поиске родителей. Любитель стильной одежды талантливый кодер Борис и технарь, очкарик и интроверт Игнат всегда готовы помочь другу. Очередной эксперимент приводит к тому, что трое хакеров вмешиваются в программный код инопланетного происхождения. Так Федор, Борис и Игнат впутываются в межгалактический конфликт землян и далекой цивилизации комодианцев. Теперь от друзей зависит судьба всей планеты.