Главная героиня картины «Дети моря» - Рука Азуми, которая учится в средней школе и занимается гандболом. Когда только-только начались каникулы, девушка попала в неприятную ситуацию, не имея теперь возможности ходить в клуб из-за того, что непристойно себя повела. Ей пришлось уйти из дома, и тогда она отправилась в Токио, там встретила загадочного подростка по имени Уми, он был без ума от моря и воды. Утром следующего дня Рука направляется к отцу Масааки, он работает в океанариуме. Там она опять наблюдает Уми, который в этот раз плавал в огромном аквариуме с рыбами. Она узнала, что парень вместе со своим братом вырос в море в стае дюгоней. После этого Уми пропадает, и главная героиня пускается на поиски, по пути сталкивается с его братом-близнецом Сорой. Этот парень более спокойный, чем младший братец, но, тем не менее, он производит не лучшее впечатление на девушку. В это время в море упал метеорит, и по миру прокатились странные явления.